MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 12343

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020558	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020558	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020558	G	7	7	306	312	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020558	GCA	2	6	1744	1749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020558	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020558	T	6	6	1804	1809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020558	ATTA	3	12	1810	1821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020558	A	7	7	1848	1854	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020558	A	6	6	3019	3024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020558	T	7	7	3055	3061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020558	A	7	7	4475	4481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020558	T	7	7	4504	4510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020558	AATA	2	8	4512	4519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020558	C	6	6	4524	4529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_020558	A	7	7	4542	4548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020558	AT	3	6	4561	4566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020558	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020558	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020558	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020558	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020558	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020558	T	7	7	10643	10649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020558	A	6	6	10656	10661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020558	A	6	6	10706	10711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020558	TGA	2	6	11547	11552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020558	A	7	7	12683	12689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020558	TAA	2	6	12696	12701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020558	A	6	6	12712	12717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020558	TAT	2	6	12746	12751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020558	AGT	2	6	15741	15746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020558	T	7	7	15771	15777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020558	AT	3	6	15836	15841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020558	A	6	6	15924	15929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020558	T	7	7	15939	15945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020558	T	6	6	15969	15974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020558	CTT	2	6	15999	16004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020558	A	7	7	16831	16837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020558	TTG	2	6	16862	16867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020558	AGC	2	6	16872	16877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020558	G	6	6	17167	17172	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020558	T	7	7	20141	20147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020558	TAATT	2	10	20207	20216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020558	AAT	2	6	20259	20264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020558	CTC	2	6	21261	21266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020558	T	6	6	21329	21334	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020558	A	7	7	21391	21397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020558	ATT	2	6	21403	21408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020558	GAG	2	6	21465	21470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020558	TCA	2	6	22935	22940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020558	A	6	6	23950	23955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020558	CG	3	6	23994	23999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020558	AAG	2	6	25674	25679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020558	GGA	2	6	27309	27314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020558	T	6	6	28065	28070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020558	AAAT	2	8	28733	28740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020558	A	7	7	28748	28754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020558	AT	3	6	28780	28785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020558	TCA	2	6	28791	28796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020558	A	6	6	28897	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020558	AGGA	2	8	28911	28918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020558	GTC	2	6	28920	28925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020558	TAAA	2	8	30840	30847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020558	T	6	6	31900	31905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020558	T	7	7	31927	31933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020558	T	6	6	31960	31965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020558	GAAA	2	8	31982	31989	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020558	A	6	6	31998	32003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020558	A	7	7	32358	32364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020558	T	6	6	32383	32388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020558	T	6	6	32405	32410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020558	AGT	2	6	32416	32421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020558	CAT	2	6	32434	32439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020558	AGT	2	6	32444	32449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020558	T	7	7	32464	32470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020558	TCACCA	2	12	32538	32549	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020558	T	6	6	32609	32614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020558	ATT	2	6	32642	32647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020558	GAA	2	6	32655	32660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020558	TCT	2	6	32721	32726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020558	TCT	2	6	32826	32831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020558	ATA	2	6	32843	32848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020558	TGG	2	6	32849	32854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020558	GAAAA	2	10	32883	32892	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020558	ATA	2	6	32917	32922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020558	T	6	6	32953	32958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020558	TTG	2	6	32960	32965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020558	CCG	2	6	32994	32999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_020558	CTT	2	6	33094	33099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020558	GTT	2	6	33106	33111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020558	T	6	6	33147	33152	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020558	CCTT	2	8	33205	33212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020558	CAA	2	6	34425	34430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020558	AGG	2	6	40321	40326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020558	TCT	2	6	40337	40342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020558	A	7	7	40407	40413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020558	AAT	2	6	40429	40434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020558	ATG	2	6	40447	40452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020558	AAAT	2	8	40500	40507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020558	AGG	2	6	41562	41567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020558	AGA	2	6	41568	41573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020558	C	6	6	41593	41598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_020558	AGG	2	6	45129	45134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020558	ATAA	2	8	47063	47070	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020558	GACTT	2	10	47092	47101	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_020558	TAAA	2	8	47125	47132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020558	AGTG	2	8	47142	47149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020558	T	8	8	47823	47830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020558	TC	3	6	47844	47849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_020558	TTAG	2	8	47876	47883	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020558	TGA	2	6	47891	47896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020558	A	6	6	49131	49136	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020558	ATA	2	6	49257	49262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020558	ATT	2	6	49284	49289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020558	GCTC	2	8	49294	49301	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020558	ATGGT	2	10	49344	49353	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020558	AGG	2	6	49386	49391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020558	GAG	2	6	49734	49739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020558	AGG	2	6	50317	50322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020558	T	6	6	50607	50612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020558	AAG	2	6	50651	50656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020558	TATT	2	8	50668	50675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020558	TA	3	6	50687	50692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020558	A	7	7	50698	50704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020558	T	8	8	51377	51384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020558	TAAA	2	8	51400	51407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020558	TAT	2	6	51431	51436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020558	A	6	6	51477	51482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020558	T	6	6	51498	51503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020558	TTA	2	6	51546	51551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020558	TAAAA	2	10	52383	52392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020558	GGA	2	6	52436	52441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020558	AACA	2	8	52509	52516	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020558	T	6	6	52520	52525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020558	TGCTA	2	10	52557	52566	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020558	TTTA	2	8	52575	52582	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020558	GAT	2	6	52602	52607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020558	ATTG	2	8	52614	52621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020558	AAAAAT	2	12	52645	52656	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020558	GTA	2	6	52657	52662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020558	TTA	2	6	52688	52693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020558	TACT	2	8	52697	52704	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020558	TAG	2	6	52718	52723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020558	TTTTA	2	10	52725	52734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020558	ATG	2	6	52757	52762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020558	TTG	2	6	52819	52824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020558	TCT	2	6	52836	52841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_020558	ATTG	2	8	52848	52855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020558	TTG	2	6	52877	52882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020558	TAT	2	6	52902	52907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020558	T	6	6	52907	52912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_020558	A	6	6	58557	58562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_020558	CCT	2	6	100596	100601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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291	NC_020558	AGG	2	6	102060	102065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
292	NC_020558	T	7	7	102484	102490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_020558	AAG	2	6	102525	102530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
294	NC_020558	CCG	2	6	102541	102546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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432	NC_020558	ATC	3	9	135650	135658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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